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法媒:计算机算力或成抗疫关键 制作新冠病毒3D模型

原标题:法媒:计算机算力或成抗疫关键制作新冠病毒3D模型

参考消息网4月27日报道法媒称,计算机和超级计算机将有一个光荣的任务:制作新冠病毒蛋白质的3D模型。最初只有3万台计算机,现在通过Folding@Home项目已经有超过70万台计算机共同参与进来。该项目负责人、美国生物化学家格雷格·鲍曼高兴地说:“有了这一参与劲头而且吸引了很多个人和机构的加入,我们已经虚拟地创造了世界上最强大的计算机。”

据法国《快报》周刊网站4月25日报道,真实情况肯定会略有不同。从科学角度讲,通过Wi-Fi联网交替进行数百万次小量计算,远远比不上超级计算机集中算力完成一项任务那么有效。另外,Folding@Home项目所宣布的每秒240亿亿次浮点运算能力,可能从未被完全调动并运用过。不过该项目仍能让人们对一件事情的认知取得进展——蛋白质的模型构建,尤其是新冠病毒蛋白质模型。

巴黎索邦大学教授让-菲利普·皮克马尔表示:“这方面的研究正处于爆发期。全球有数十家实验室在进行。它们将病毒分离成很多部分,试图以虚拟的形式来用模型表述。”

这么做的目的是什么呢?是为了推进对新冠肺炎的治疗。因为,要想使一种药物有效,研究人员必须清楚药物能在哪方面发挥作用。3D模型可以描绘出药物发挥作用的机理,然后虚拟其与靶标(例如某种病毒)的互相作用。此后再进行体外和体内试验。

皮克马尔解释说:“截至目前,医生们从自己的认知出发进行了一些试验。我们则基于物理学、信息技术或化学而进行不同的研究。这种研究可以让人们对病毒的认知更进一步,其结果也会与其他实验室进行分享。在新冠病毒问题上,存在着这样一种风险——尽管时间在推移,却找不到任何有效的克制手段。这种情况过去在对艾滋病的研究上就出现过。目前艾滋病没有任何疫苗,人们不得不依靠计算机的算力来研究预防性治疗。”

如果进行中的试验的最后结果令人失望,计算机也许能带来新的治疗理念。皮克马尔进一步解释道:“一旦我们有了好的模型,就可以进行虚拟筛选,也就是找到那些能与病毒相互作用的药物成分。”但由于存在成千上万种可能性,模拟过程可能会耗时很久,而且精确的结果也需要很大的运算量和时间。

此外,算力也并不是获得成功的保障。还应当考虑到数不清的物理规律。皮克马尔表示:“在微观层面,我们会看到水、离子以及高能电子区的相互作用……我们对物理的认知仍有不少偏差。”

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