深圳是中华穿山甲、猕猴、黑嘴鸥、黑脸琵鹭、卷羽鹈鹕、白肩雕等陆生野生动物重要的栖息地。12月20日，国家林业和草原局公布我国《陆生野生动物重要栖息地名录》（第一批），本月起实施。广东内伶仃-福田国家级自然保护区及其重点保护的野生动物在册。
该《名录》涉及31个省、区、市共789处，覆盖565种国家一、二级重点保护野生动物的栖息地、繁衍地、迁飞地，涉及兽类127种、鸟类339种、两栖爬行类62种、昆虫37种，保护了82.36%的国家重点保护陆生野生动物种类。
深圳是我国生物多样性最为丰富的地区之一，建立了以广东内伶仃-福田国家级自然保护区、广东梧桐山国家森林公园、珠江口中华白海豚国家级自然保护区等国家级保护单位为代表的自然保护地体系。其中，内伶仃岛是穿山甲、猕猴等的重要栖息地，福田红树林湿地是黑嘴鸥、黑脸琵鹭、卷羽鹈鹕、白肩雕等候鸟的重要栖息地。
截至2023年5月，深圳累计记录自然分布的陆域野生脊椎动物共计650种，主要分布在深圳湾和梧桐山、三洲田、排牙山、七娘山等区域。深圳福田红树林国际重要湿地和香港米埔内后海湾国际重要湿地，是东亚-澳大利西亚迁飞通道上候鸟的重要驿站和栖息地，是黑脸琵鹭的全球第三大栖息地，每年约有3000只黑脸琵鹭停歇。内伶仃岛是深圳面积最大的海岛，也是快乐的“猕猴王国”，现有约23个猴群，1200多只猕猴。
当前，深圳以“绿美广东”生态建设为引领，正全力推进国际红树林中心、穿山甲保护研究中心深圳分中心、仙湖植物园对标国家植物园建设等重点项目，持续提升生物多样性保护水平。
