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武大联合团队大幅提升新冠病毒阳性检出率 还能同时检测10种病毒

原标题:武大联合团队大幅提升新冠病毒阳性检出率还能同时检测10种病毒

来源:湖北日报

研究团队在武汉新型冠状病毒定点医院利用NTS进行检测

研究团队在武汉新型冠状病毒定点医院利用NTS进行检测

楚天都市报3月3日讯(记者柯称记者陈丽霞)自新冠病毒疫情爆发以来,一直存在临床疑似病例难以确诊的问题。记者从武汉大学获悉,武汉大学联合团队创新性开发了纳米孔靶向测序检测方法,能大幅提升病毒阳性检出率,并能实现当天同时检测新冠和其他10种常见呼吸道病毒并监测病毒突变。

据了解,既往新冠病毒诊断依赖于qPCR核酸检测,但是该方法显示出较高的假阴性率和低敏感性,阳性检出率仅为30%至50%,从而导致临床高度疑似新冠感染患者或低病毒潜伏的“假痊愈患者”检测“假阴性”现象。此外,核酸检测无法同时检测其他秋冬季高发、症状与新冠相似的其他呼吸道病毒,给疫情防控和患者分流管理带来极大挑战。

武汉大学药学院刘天罡教授,武汉大学人民医院李艳教授、余锂镭教授,武汉臻熙医学检验实验室有限公司总负责人付爱思博士等迅速组建联合团队,创新性开发了纳米孔靶向测序(Nanopore Targeted Sequencing,NTS)检测方法。

刘天罡介绍,核酸检测好比是用一把狙击枪去击打样本中的病毒核酸,有一定概率击不中,而NTS技术不是用狙击枪,而是撒网,同时撒十几张网,这样能捕获病毒核酸的概率大大增加,不仅如此,还能在捕获的同时读出序列。这样,一次检测不仅可以确诊是否新冠,而且其他常见的呼吸道病毒,包括博卡病毒、鼻病毒、人间质肺病毒、呼吸道合胞病毒、冠状病毒、腺病毒、副流感病毒、甲型流感病毒、乙型流感病毒和丙型流感病毒等,也能同时检测出来,能为医生分诊提供确切依据。更重要的是,还能检测在病毒传播期间与毒力相关的基因是否发生了突变,从而迅速为后续的流行病学分析提供信息。

在研究中,团队平行测试了NTS和qPCR两种方法。结果表明:45个临床高度疑似新冠感染患者的样品,NTS共鉴定出34个阳性样品,比qPCR多出15个;16个临床已确诊新冠感染患者中,NTS全部检测阳性,qPCR仅9个阳性。临床确诊样本显示,NTS比qPCR的阳性检出率提升43.8%。此外,对于高浓度病毒样本,NTS仅需测序10分钟即可检测阳性。即使极低浓度病毒样本,也仅需测序4小时完成检测,从收到样本到出具结果,全程控制在6-10小时。而且该技术所需的纳米孔测序平台对实验室要求不高,其中最小测序仪MinION是便携式的,因此NTS也适合不同级别的医院使用。

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